从目前流传下来的席书编次、朱家相增修的《漕船志》来看，该志采用纲目体结构，八卷十类，设建置，包括厂地、草场、闸坝附；奉使；船纪，包括船数、船式、船号、船等、船限附；料额，包括芜杭岁办、抽分税办、抽分物料则例、人匠工办、军余工办、减存料办附；公署；官署；人役；法例；兴革，条约附；艺文，系统地记述了明代漕船的修造和管理制度，反映了明代漕政的发展。其主要内容有：
（一）漕船厂建置
明代漕船有海船和内河浅船两种，罢海运后主要是内河浅船，不仅设置专门机构督造，而且实行官造官修制度。据《漕船志》卷一《建置》记载，"洪武元年（1368），诏中书省漕四方之粟于京师。洪武三十年（1398），议海运辽东以给军饷。是时河海运船俱派造川湖诸省及龙江提举司"。永乐七年（1409），淮安、临清肇建清江、卫河二厂，"南京直隶、江西、湖广、浙江各总里河浅船俱造于清江，遮洋海船并山东、北直隶三总浅船俱造于卫河，大约造于清江者视卫河多十之七"。宣德年间，"议造江西、湖广、浙江、江南直隶各总浅船俱归原卫，惟南京、镇江、江北直隶诸卫隶于清江"。之后各船虽归原卫计料修造，但"各船回至清江本厂，行委提举司官匠估计应该修理或改造合用料物，填注票帖给官军，回至原卫照数支给买料修造"。成化十年（1474）以后方令各司府自行估计修理。成化二十三年，因御史谢文、郎中洪汉奏请，"议造镇江浅船亦改归原卫"。正德十六年（1521），刑科给事中田赋又建议将卫河总运船俱归隶清江厂，到嘉靖三年（1524）工部题准，卫河总运船俱归清江厂团造。对于明代清江船厂的设置，该志在《建置》中也作了阐述和分析，并指出不在当时木材集散地芜湖、仪真设船厂的原因："芜湖、仪真，群商四会，百木交集，船厂不设于二处而设于清江，何也？缘永乐初江南粮饷民送于淮，官军运船俱于淮安常盈仓转输，此厂之所由建也。况长淮分天下之中，北达河泗，南通大江，西接汝蔡，东近沧溟，乃江淮之要津，漕渠之喉吻。船厂之建，非但便于转输，实我国家一统之訏谟、万世之长计也。"之所以在清江设厂，主要是由淮安在漕粮转输中的地位所决定的。
清江漕船厂位于山阳、清河二县之间，"永乐初，平江伯陈公瑄督漕，查闲旷之地建盖厂房，令各卫所官旗鳞次而居，以为造船之所"。《漕船志》卷一《建置·厂地》。清江漕船厂有京卫、中都、直隶、卫河四总厂，其下按卫所建制设有分船厂。其中京卫厂有三十四厂，涉及南京亲军卫、南京五军都督府所辖大部分卫所；中都厂有十二厂，涉及中都留守司及所提辖卫所；直隶厂有十八厂，基本以南直隶相关卫所设置；卫河厂有十八厂，涉及南直隶卫所的有通州左卫、通州右卫、淮安卫、大河卫，而直隶厂、卫河厂下辖都有大河厂、淮安厂，总计有八十二分船厂。另外，清江漕船厂还辖有京卫厂、直隶厂、中都厂三处草场，"逐年差拨官军依时打草，苫盖修补"《漕船志》卷一《建置·草场》。厂房。另辖有建于清江浦运河上的板闸、移风闸、清江闸、福兴闸、新庄闸五闸，清江东坝、清江西坝二坝，以便于运送造船物料等。这也充分说明漕船厂设施的齐备。
（二）漕船厂官员的设置情况
永乐十三年（1415）罢海运后，"始更浅舟由里河以达京师，南于淮安清江、北于临清卫河设二提举司，以职专造理，是即先代舟楫之署，而经济规模尤大焉者。天子尚念储峙切邦家之脉，舟楫适济川之具，惟兹大计经理非人，则利济之功缺而失乃事矣。复于都水部各出郎官一员监领厂事。在永乐、宣德间，或遣郎中，自景泰后例遣主事，额以三年一代。代而往者，其间有升藩臬之司，有擢都台之寄，有位六卿之列，固将利济于后先矣"。《漕船志》卷八《艺文》，席书《清江厂题名记》。说明督理漕船厂官员设置、任免及升迁情况，也反映了该官职的重要地位。
据《漕船志》卷二《奉使》，对督理清江漕船厂的官员设置原委及任免、赴任程序记载更为详尽："永乐十三年命工部差都水司一员督理清江船厂。先年差官川湖等处催造，不为常例。是年始差部官专理厂事。是后或差主事、郎中，无定例焉。景泰后例差主事一员，率三年一代。天顺间，漕运衙门题奉钦依，札委兼管淮安一带河道，缘本厂收放船料，不能离职辞之，仍兼管清江等五闸。正德十五年（1520）四月，内奉部札，题奉钦依，行令不妨原务，兼管清江等五闸，以时启闭，著为例。仍札仰淮安府卫管河管闸官吏，一体钦遵，听其提调管理。例凡奉使清江者率三年代，先任者将满四月前，先具满呈，差人赴部呈代，候吏部注选一员赴部到任，仍候题差领有札付，赴内府给领精微批文，兵部起关，应付前来相代。至厂之日，于淮安府调取本部原发号簿，比对朱墨字号相同，然后行事。"这段描述为明代职官研究提供了生动的事例。
永乐十三年设置督理清江船厂官员时，设置了工部厂、工部分司。正统元年（1457）建提举司，正统二年（1458）主事胡臻始请设提举司官二员。嘉靖九年（1530）邵经济督理船厂后，又建了清江造船总厂和卫河造船总厂。其官员设置为：把总官五员，清江厂四员，卫河厂一员，作为管理厂务的官员，"旧设二员，遇缺漕运衙门访取各卫指挥贤能者，俱以本等职衔分理造船事务。正德四年（1509），始假以把总名色"；各总厂官四十员，其中清江厂官三十六员，南京三十四厂设十二员，中都总十二厂设十员，直隶总十八厂设十四员；卫河厂四员，山东总七厂二员，遮洋总十一厂二员，各造船厂"船数多者特设专官管理，少者附各厂兼摄"。《漕船志》卷五《公署》。管理厂务的官员由漕运衙门访取。这说明清江造船厂、卫河造船厂从隶属关系上来说属于漕运衙门，提举司及其主事则属于工部所属，故由工部派遣。提举司与造船总厂的关系，颇类似于当今盐务局与盐业公司的关系。为保障造船厂的有效运转，还有抽分厂税课司大使一员专理商税，副使一员专理抽分，闸官四员，以及书办、算手、农民、门子、老人、阴阳生、皂隶、巡拦、军余、水手、船头、总小甲等，负责看守各坝验收抽分号票、缉查匿税货物、驾船应用、看守厂库等杂役。另外，嘉靖十八年（1539）叶选督理船厂后还建了清江书社、清江义学。从这些机构和人员的设置来看，反映了漕船厂管理体系的完善。
（三）漕船的修造与管理
这是《漕船志》记述的重点，包括漕船数目以及船式船号、漕船的损毁和使用年限、漕船木料和漕价银等，系统地反映了明代漕船修造制度。